南京有两个主要的博物馆，即南京博物院和南京市博物馆（朝天宫），后者是南京市属的博物馆。南京博物院是中国第三大博物馆，馆藏丰富，有玉器、青铜器、云锦丝织、珍宝等许多展馆。南京市博物馆以收藏六朝时期文物为主，最近的镇馆之宝是“七宝阿育王塔”。
