第一，完整性比较好的总RNA琼脂糖凝胶电泳图呈现三条带，也就是电泳图常见的28s 18s 5s核糖体RNA。且它们三条带清晰无严重拖尾。
第二，真核生物有4种rRNA，它们分子大小分别是5S、5.8S、18S和28S。
RNA电泳中可以依据核糖体RNA的大小大致判断条带的大小，RNA电泳条带上，应是28S在上，18S在下，且亮度为28S是18S的两倍。
第三，如果三条rRNA不清晰甚至拖尾严重，说明总RNA也降解污染严重。提取质量差，不能用于后续实验。
1 ）琼脂糖凝胶结构均匀，含水量大（约占 98 %～ 99 %），近似自由电泳，样品扩散度较自由电泳小，对样品吸收吸附极微，因此电泳图谱清晰，分辨率高，重复性好。 （
2 ）琼脂糖呈透明状，无紫外吸收，电泳后的样品可直接用紫外检测；电泳后区带易染色，样品易洗脱，便于定量测定。 （
3 ）操作简单，电泳速度快，样品不需事先处理就可进行电泳。
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