计算机选案只是稽查选案的一种方法，稽查选案还包括人工选案、举报、上级交办、内部移交、外部转办、专项稽查等。
纳税评估需要对评估对象进行分析，分析的方法之中有计算机筛选活计算机模型分析等，比如按照纳税评估指标由计算机对税收数据和财务数据进行自动分析确定;但是纳税评估的确定评估对象的方法不只计算机筛选一种。
两者是税务机关不同的工作部门职能，都可以采用信息化手段来实施。现在有人提出将二者基于计算机系统的分析、筛选工作进行合并处理，这是本年度税务改革的一个讨论内容。
稽查和纳税评估都是税收管理的具体职能。稽查的职能重在对偷逃税等违反税法行为的专门检查，是一种特殊的税收检查;纳税评估的职能重在税务机关对纳税人履行纳税义务情况的分析、评估和处理，是税务机关进行日常税源管理的基本方式。
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