虽然你户口在南京，当你长期居住在北京，所以，你应该在北京办理的驾驶证，驾驶证与户口所在地只是一个法律的对应关系。也就是你发生交通事故后，能找到你担负法律责任的唯一途径。
你只要在北京所在地区办理长期居住证,就可以在北京申请办理驾驶证.
没有什么关系还是办北京的，比较方便
