妙蛙种子被寄放在了博士那里,是为其他神奇宝贝做调解工作.
小火龙最终进化到了喷火龙,最后放到了喷火龙山谷进行训练.
杰尼龟被放到一个城镇和杰尼龟军团的其它杰尼龟一起组成了救火队.
绿毛虫最终进化成巴大蝴,之后和一只粉色巴大蝴去远方繁殖.
比比鸟进化成了比雕,后来被放置到一个大森林里保护小的野生神奇宝贝.
有的流在别的地方
有的放在博士那里了
只要去一个新的区域 小智就会重新捕捉
不变的只有皮卡丘
妙蛙种子在研究所后院维护治安
杰尼龟好像和以前的伙伴在一起组建救活队
小火龙进化成喷火龙最后被放生了
绿毛虫最终进化成巴大蝴,之后和一只粉色巴大蝴去远方繁殖、喷火龙喷火龙山谷进行训练、杰尼龟和杰尼龟军团的其它杰尼龟一起组成了救火队、妙蛙种子放在大木博士那还有比雕放在一个森林里保护小鸟们
有些是寄养在大木博士那里
有些是被派到别的地方去了，如喷火龙，杰尼龟
在AG最后几集里，妙蛙种子，喷火龙，杰尼龟，皮卡丘又聚齐在一起战斗，打败战斗金字塔神代先生。
杰尼龟跟以前的同伴一起组成一个队伍来帮助人们
小火龙被放生到喷火龙山去了
还有比比鸟放在一个森林里保护小鸟们
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