【引き出しに 铅笔が十本 あります】（在）抽屉里有十支铅笔。前面是存在的场所，后面的主谓词组是存在的内容。数量词位置正确。
【铅笔は十本引き出しに あります】语序不对。不能这样使用。
【 铅笔は引き出しに十本 あります】只能理解为主语提示。不能说错，但也不规范。
以上只是我的一点看法，请指正。
基本上是前面的这种说法。也就是说日语中的量词是放在助词和后面的动词中间。
当然你后面的这个句子日本人也能看懂。但有些奇怪。一般不这么说。
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