企业收到政府补助时该不该给政府有关部门开发票一定要结合我们现行的增值税等法规规定，该开的才能开，不该开的不能开。但企业有时迫于无奈，给政府有关部门开具了不该开具的发票，但也有的企业是与政府有关部门积极沟通，讲清了政策，最后也没给开的。
根据《国家税务总局关于中央财政补贴增值税有关问题的公告》（国家税务总局公告2013年第3号）规定，自2013年2月1日起，按照现行增值税政策，纳税人取得的中央财政补贴，不属于增值税应税收入，不征收增值税。
现行的增值税应税行为包括销售货物、劳务、服务、无形资产、不动产五类。根据《增值税暂行条例》第一条规定，在中华人民共和国境内销售货物或者提供加工、修理修配劳务以及进口货物的单位和个人，为增值税的纳税人，应当依照本条例缴纳增值税。
根据《财政部、国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号）附件1：《营业税改征增值税试点实施办法》第一条规定，在中华人民共和国境内（以下称境内）销售服务、无形资产或者不动产的单位和个人，为增值税纳税人，应当按照本办法缴纳增值税，不缴纳营业税。
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