查理大学包含17个学院:天主教神学学院 新教神学院 胡斯教派神学院 法律学院 第一医学院 第二医学院 第三医学院 Plzeň医学院 Hradec Králové医学院 药剂学学院in Hradec Králové 哲学学院 自然科学学院 数学和物理学院 教育学院 社会科学学院 体育运动学院 人文科学学院