你可以申请劳动争议仲裁,要求归还档案,或者起诉公司侵权
那你当初和这家公司签订的合同中规定的违约金是多少呢?如果合同中明确的违约金的数额,你只需支付相应数额即可.如果合同中没有明确违约金的数额,则支付违约金的数额不应超过实际月工资的5倍(不保证对),实在不行,你可以去律师事务所咨询一下.