我毕业和某公司签订了三方协议，协议上讲实习期三个月因个人原因辞职

以劳动合同为准，即使你这个辞职要扣违约金的约定，一般投诉当地劳动仲裁可以解决！但是，如果你是诸如参加公司相关培训这样产生的违约金，是合法的。如果没有培训，只是一般的上岗，不会有违约金的，公司违法了。

不需要，按照劳动合同法的规定，单位和职工之间的合同是不能随意约定职工离职要支付违约金的，这个是违法的。
司法依据：《劳动合同法》
第二十五条　除本法第二十二条和第二十三条规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
第二十二条　用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。
劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
用人单位与劳动者约定服务期的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期期间的劳动报酬。
第二十三条　用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。
对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。

这个问题，我个人觉得违约金是可以不交的，你可以找当地的劳动局具体去咨询一下