①加入的丙酮太多，色素的比例小，则色素带颜色较淡，①正确；
②无水乙醇和丙酮都能提取色素，②错误；
③层析时，层析液没过滤液细线，使色素溶解在层析液中，色素带颜色较淡，③正确；
④研磨时没有加入CaCO3，使部分色素被破坏，④正确；
⑤研磨时没有加入SiO2，导致研磨不充分，色素没有充分提取，⑤正确；
⑥取的叶片的叶脉过多，叶肉细胞过少，绿叶中所含色素少，⑥正确；
⑦在画滤液细线时，等滤液干燥后再重复两到三次，画滤液细线次数太少，会使滤纸上的色素量少，也会导致滤纸条上色素带颜色较浅，⑦正确；
⑧使用放置数天的波菜叶，使部分色素被破坏，叶中所含色素少，⑧正确．
故选：C．
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