个人独资企业是不是按生产经营所得交个人所得税，不用交企业所得税？如果交个税是什么时候交，何时申报。

1.交个人所得税，不用交企业所得税。
2.个个人所得税的申报时间，一般是每季度的15号前号申报，年度申报在纳税年度终了后3个月内。
3.如果因生产经营需要，可以将单位账户上的钱转入老板私人账户。否则不可以，因为独资企业要计算成本费用和所得额的。

关于你的问题，首先有两个事项需要明确。一是该独资企业的征收方式（即是查账征收还是核定征收）；二是该企业申报的方式，即是每月都报，还是采取季报一次的方式。
只有在上述两个问题明确的情况下，才好对此作分析。
如果是查账征收，那么只要企业当月的会计利润显示为负，则不需要缴纳个人所得税；反之，则交。如果是核定征收，那么它不关心你的成本费用，更不关心你的利润，只关心你的收入，如果你当月有收入，那么就需要交个人所得税。
至于你所说的负3万和正1万，对照上述分析解决了。
你所补充的问题表明你对投资者和普通员工的个所得是处理得不当的。你不能把你独资企业投资者的个所税当作员工的一并进行申报，你要以个人独资企业投资者的名义按个体生产经营所得来为投资者计算缴纳个人所得税。明白吗？
其实，你是月报还是季报与你查不查账征收没有关系。我上面提到的问题只是想确定你们到底属于什么征收方式。
对你的损益表而言，假设为你说的查账征收，不管它超没超过两千，都要交税。更为一般的理解，只要你的报表利润为正，你就要交税。