A、每个物种都是一个独特的基因库．生物种类的多样性是由基因的多样性决定的，所以其实质就是基因多样性，说法正确．
B、由分析可知：生物的多样性包括生物种类的多样性、基因的多样性和生态系统的多样性，说法正确．
C、威胁生物生存的原因有栖息地被破坏、偷猎、外来物种入侵、环境污染、其他原因等．其中最主要的原因就是栖息地等生态环境的破坏以及偷猎．保护生物的栖息环境，保护生态系统是保护生物多样的根本措施，说法正确．
D、每个物种都是一个独特的基因库．基因的多样性决定了生物种类的多样性，威胁生物生存的原因有栖息地被破坏、偷猎、外来物种入侵、环境污染、其他原因等，说法错误．
故选：D
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