首先，这两款流量计的安装方式不同，
电磁流量计大多数是管段式安装还有少部分插入式，这两种安装方式需要在管道上切开/挖孔，管道整体需要截流停工，才能安装；
而超声波流量计可选择外夹式、插入式和管段式三种安装方式，常用的是外夹式和插入式两种，都是无需停工安装。其中外夹式安装更是不会破坏管道，不会和被测流体接触，无任何泄露的可能。
然后，这两款流量计对于管径通用性相差甚远，
电磁流量计都是针对一款管径使用，甚至管道流体的不同对应的流量计内衬也不同，无法在别的管道上使用；
而超声波流量计外夹式和插入式，没有这方面的苦恼，可以通用在不同材质的，不同尺寸的，不同被测流体的管道。
而且，这两款流量计测量管道流体的方式是不同的，
电磁流量计是采用电磁感应原理， 根据导电流体通过外加磁场时感生的电动势来测量导电流体流量的一种仪器，所有导致它只能测量导电流体的数据；
而超声波流量计采用时差法测量，通过上游传感器发出信号何下游传感器发出信号的时间差值计算流体流量，所以超声波流量计除了不能测量固态含量多或者含有许多气泡的流体，可以测几乎所有流体。
PS.以上测量都是满管状态，电磁流量计和超声波流量计均只能测量满管状态下流量。
而这两款流量计的通讯协议都是比较丰富的，几乎都是标配了4-20mA和RS485，更有甚者可以选配市场上别的通讯协议，这是比其他流量计都优势的。迅升不但标配了4-20mA和RS485，还有OCT报警设置(可设置上下限，达到会发出报警信号)，也支持选配BACnet、LoRa等通信协议。
且这两款流量计的后期维护各有不同，
就检定周期有所相差，国家规定超声波流量计的检定周期为三年一次，而电磁流量计的检定周期是两年一次。
电磁流量计需检查外部设备是否进水或其他物质，附近是否增加电磁场设备或电线横跨仪表，这些都会对电磁流量计的测量产生影响，若是电磁流量计检测数据有偏差，那将截流停工拆卸下来维护修理，期间可能无法作业。
而超声波流量计会方便许多，维护只需查看流量计显示的SQ值，声速比等参数是否良好，如果数值有问题，可以排查传感器位置是否有异物或松动，且外夹式和插入式都是可以带压检测维护。
电磁流量计是利用法拉第电磁感应定律制成的一种测量导电液体体积流量的仪表。在电磁流量计中，测量管内的导电介质相当于法拉第试验中的导电金属杆，上下两端的两个电磁线圈产生恒定磁场。当有导电介质流过时，则会产生感应电压，该电压与流体的流速成正比关系，进而得到流量值Q。
超声波流量计采用时差式测量原理：一个探头发射信号穿过管壁、介质、另一侧管壁后，被另一个探头接收到，同时，第二个探头同样发射信号被第一个探头接收到。由于受到介质流速的影响，二者存在时间差Δt，根据推算可以得出流速V和时间差Δt之间的换算关系V=(C2/2L)×Δt，进而可以得到流量值Q。
原理不同，测量环境不同，所测介质不同
电磁流量计主要用于导电介质的流量测量，而超声波流量计，对于介质的受限就少一些，超声波流量计原理为为传播速度差法(直接时差法、时差法、相位差法和频差法)、波束偏移法、多普勒法、互相关法、空间滤法及噪声法等。适用一些大口径的管道流量测量。
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