A、突变性状在当代就显现，说明该突变为隐性基因变为显性基因引起的，A错误；B、突变株为杂合子，其自交可产生“一秆双穗”的纯合子，B正确；C、基因突变不会导致基因所在的染色体形态变化，所以观察有丝分裂中期细胞染色体，无法判断发生基因突变的位置，C错误；D、将该株水稻的花粉离体培养后还需诱导染色体加倍，再筛选才能获得稳定遗传的高产品系，D错误．故选：B．
