java 中我定义了一个二维数组，比如agent1[i][j]，现在我想给给这个二维数组定义一些属性，

那你二维数组里面要放对象的，相当于 这样用法 Entry obj = agent1[i][j]；然后 obj.m_dBestfitness 获取属性。

那你要用对象了，相当于二维数组取出来的值就是对象了。Entry obj = agent1[i][j]; obj.m_dBestfitness

对于对象类型的数组。如：
public class ArrayTest2{
public static void main(String[] args) {
Person[] p = new Person[3];
p[0] = new Person(10);
p[1] = new Person(20);
p[2] = new Person(30);
for(int i = 0; i < p.length; i++) {
System.out.println(p[i].age); //分别打印3个年龄
}
Person[] p2 = new Person[5];
for(int i = 0; i < p2.length; i++) {
System.out.println(p2[i]); //分别打印5个null
}
}
}
class Person{
int age;
public Person(int age){
this.age = age;
}
}

写一个示例给你参考下

在你的数组类型的类里定义属性就行了