毛巾材料主要有棉，粘胶（包括竹纤维、木纤维、莫代尔等），真丝和功能性超细涤纶纤维。前两年也风行过一阵木棉纱做毛巾，起因是东华大学一位教授搞了一个木棉纺纱的专利，号称木棉纤维比棉纤维的吸水性和保暖性还要好。实际上那位教授只是凭空想象，只注意到木棉纤维的中腔更大，没注意木棉纤维的腔壁极薄且脆。
由于棉纤维和粘胶纤维良好的吸水性和相对较好的亲肤性，被广泛地应用于毛巾中；真丝由于本身是蛋白质成分，具有极佳的亲肤性，用其所织成的毛巾是最好的美容毛巾，但因为成本很高，国内消费者很少见到。至于号称吸水毛巾的超细纤维毛巾，更多的用途是做抹布。
顺便纠正一下前一位网友的说法，木棉和榉木没有半毛钱的关系，木棉是木棉树果实中纤维，因其与棉花极为相似，故称木棉。
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