广西钦州农业学校的前身是广东省合浦县立农业职业学校,1933年10月1日在合浦县张黄镇(今广西壮族自治区浦北县)创办。是广西历史最悠久的一所中专学校。1951年12月改为广西省办,并迁至钦州现址。
由于行政区域和隶属关系的改变,学校曾几度易名。1952年1月,奉广西省农林厅批复,名为“广西钦州农业技术学校”,由广西壮族自治区农林厅领导。1953年春,按省农林厅通知,改名“广西省钦州农业学校”。1955年秋,钦州专区划归广东省管辖并改为合浦专区,学校则由广东省农业厅领导,校名为“广东省钦县农业学校”。1957年秋,合浦农校并入广西钦州农业学校。1958年9月,学校升格为“华南农学院合浦分院”,后合浦专区并入湛江专区,分院并入华南农学院湛江分院,学校继续办中专。1965年8月,原合浦专区区域再次划归广西管辖并成立钦州专区,此时校名为“广西钦州农业学校”,归广西壮族自治区农业厅领导。1969年秋,学校由广西壮族自治区下放钦州地区行署领导,改名为“广西钦州地区农业学校”。1969年9月-1975年8月,由于中专在校生较少,这段时间经钦州地区行署批准曾开办钦州地区农校附设中学。1980年11月13日,经广西壮族自治区人民政府批准,广西钦州农业学校收归自治区农业局(现广西壮族自治区农业厅)领导,更校名为“广西钦州农业学校”至今。