南开大学2012年教育部学科评估全国前十专业（20个）：
世界史、化学2
理论经济学、统计学4
政治学、中国史、数学、光学工程5
应用经济学、工商管理6
社会学、考古学、植物保护、图书情报与档案管理7
哲学、马克思主义理论、生物学、环境科学与工程8
物理学9
中国语言文学10
武汉大学前十专业（23个）：
总体来说，南开大学和武汉大学都是名牌大学，擅长文理，医学和工学相对较弱，不过武大工学有几个很厉害（如测绘，水利，软件工程）。
两校均为国家副部级大学，985工程大学，各具特色。学科优势请参见：教育部学位中心的一级学科评估(2007-2009)，地址见参考资料。 南开大学擅长：经济学、金融学、化学、数学、历史、工商管理、植物保护学、环境科学工程、哲学、政治学等武汉大学擅长：法学、新闻学、哲学、测绘学、图书馆学、公共管理学等
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