根据题意,该物质由两种元素组成,1个分子由3个原子构成.A、O3由同种元素组成,故错;B、CH4由两种元素组成,但1个分子由5个原子构成,故错;C、ClO2由两种元素组成,1个分子由3个原子构成,故对;D、HNO3由三种元素组成,故错;故选C.