依据像你所说的情况，正常来讲你是应该直接走国家干部手续的不过如果你走聘用制干部手续也可以。全日制本科毕业正常来讲就拥有国家干部身份，所以正常的聘用制度，与晋升制度都是按照国家干部资质来走的。就是由组织部门考核、任命、备案的，终身制的。由于以前的高学历管理人才较少，所以从基层晋升的工人国家为了区分其与正常干部出来了聘用制这么一项。但是由于近些年人才输送过快，国家事业单位人员过剩，以及综合素质变高，干部需求变大这样的情况，这个聘用制干部手续也用于拥有国家干部身份的科员。我建议你应该就此询问一下贵单位的行政部门。调动一下相关关系，弄清楚提早想办法。我也有朋友因为这样的问题闹心了很久，所以毕竟是你一辈子的事儿，多上点心。也希望你最后得到想要的。
简单点说，区直事业单位副科级还没有到组织部考核的那个步奏呢，科级也探不到组织部去考核。
只有到了副处级别（不是每个副处级都是只有的），身份转变成公务员以后，才会有组织部去考核任命。
不必在意这些小事，是金子总会发光，随便办个手续进去就行了
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