在公司制度中是不是不能有扣工资的条款？

在公司制度中不能有扣工资的条款，即使有也是无效的。
现在企业没有权利对员工进行罚款，因为政企分离以后，企业已经没有行政管理权，所以也就不能对员工进行罚款，除非是员工的行为给企业造成了损失。
目前我国境内无论何种类型的企业，都因为没有了行政管理权，而没有权利对本企业的员工进行罚款。因此，目前所有企业的任何规章制度中只要有罚款的处罚方式就是没有法律依据的，都是违法的，都因为违法而无效。既然企业关于罚款的规定是违法无效的，那么企业从员工的工资里扣罚款的行为也是没有依据的，属于违法行为。
员工因个人原因给公司造成损失的，公司可以按照合同约定要求其赔偿经济损失，这个损失赔偿可以从工资里扣，但是最多不能超过当月工资的20％。除此以外，除了法定的代扣工资情形以外，企业不可以以任何理由扣减员工的工资。

法律依据
（一）《劳动法》
第102条规定：“劳动者违反本法规定定的条件解除劳动合同或者违反劳动合同中约定的保密事项，对用人单位造成经济损失的，应当依法承担赔偿责任。”
（二）劳动部《违反〈劳动法〉有关劳动合同规定的赔偿办法》 第4条规定：“如果劳动者违反规定或劳动合同的约定解除劳动合同，对用人单位生产、经营和工作造成的直接经济损失的，劳动者应当赔偿用人单位经济损失。”
（三）《工资支付暂行规定》
第十六条 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
（四）《劳动合同法》
第二十九条 用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定，全面履行各自的义务。
第九十条 劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
（五）《民法通则》
第一百零六条 公民、法人违反合同或者不履行其他义务的，应当承担民事责 任。 公民、法人由于过错侵害国家的、集体的财产，侵害他人财产、人身的应当承担民事责任。
没有过错，但法律规定应当承担民事责任的，应当承担民事责任。

二、条件
从上述法律法规的规定可以看出：劳动者如果违反用人单位的规章制度、技术操作规程和安全规程，给用人单位造成的经济损失，要求违章劳动者进行赔偿是有法可依的，也是合法的。但是实际操作中应当注意要符合以下条件：
（一）用人单位是否制定规章制度、技术操作规程和安全规程？
（二）用人单位的规章制度中或劳动合同中是否有因违章作业造成损失要求劳动者赔偿的规定或约定？
（三）用人单位制定的规章制度是否经民主程序制定并让劳动者知悉？
三、几种情形的处理建议
（一）一般过失造成的损失，按《工资支付暂行规定》规定，每月扣除劳动者本人工资的20％，但注意剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
（二）故意损坏财物造成重大损失或其它构成犯罪的情形，报案公安机关追究刑事责任，用人单位提起刑事附带民事要求赔偿经济损失。
（三）违反保密义务造成损失，按照保密协议约定要求支付违约和赔偿损失。
（四）劳动者过错造成第三人损失的，用人单位赔偿第三人损失后，可依据劳动合同或规章制度要求劳动者赔偿。

根据我国《劳动法》规定，用人单位可以从员工工资中代扣代缴下列费用：
1、工资的个人所得税;
2、员工个人负担的社会保险费;
3、协助执行法院判决、裁定由员工负担的抚养费、扶养费、赡养费;
4、法律法规规定的其他费用。
　　
用人单位还可以从员工工资中扣减下列费用：
　　1、员工赔偿因本人原因造成用人单位经济损失的费用。
对于这一条的规定应该注意，员工是否给单位造成损失不是由单位单方面说了算了，如果单位认为造成损失，而员工认为没有造成损失的话，单位扣除工人的工资是会存在问题的。因为很多单位可能片面的，扩大化的，甚至是错误的将某些损失转嫁到工人的头上，这就不合理了。那么在出现这样的争议时，到底由谁说了算了，劳动法方面的法律法规未见有具体的规定。因此，在到底是谁造成损失的事实认定上还是应该通过仲裁、诉讼的司法程序来认定。当然了，如果用人单位和工人就谁造成了损失达成一致的话，那当然可以直接从工资中扣除了。
　　2、用人单位按照依法制订的规章制度对员工进行的违纪经济处罚。
　　对于这条的规定也应该注意一下：单位的规章制度应该是依法制订的，“依法”又包含两点，第一是内容依法，即规章制度的内容不得违反劳动法及相关规定，不得违反公平公正的基本原则，第二，程序必须依法，即必须是通过民主程序制订的，进行了公示，大家都知道该规章的存在。
　　用人单位一次扣除赔偿经济损失的费用和违纪经济处罚的费用不得超过员工月工资的20%。

工资是不能克扣的，能扣的是奖金。

有，按公司法规，可以扣款

不违规不能扣钱！