楼主说的那个特殊签证想必是最近日本驻华大使馆发布的“多次往返签证”，及在签证有效期间内可以多次往返，并不只局限于冲绳，日本各地都可以，但貌似这种特殊签证只有去了冲绳才可以办√，以鼓励中国游客到冲绳旅游，但貌似这种签证还没有正式发布？
是的，办理了自由行的签证，可以去日本正常全境范围。据我所知，是在冲绳入境日本多次，往后签证方面会比较便捷。具体可以咨询
