A、细胞各部分结构的功能虽不相同，但它们是相互联系、分工合作、协调一致地共同完成各项生命活动，A正确；
B、细胞膜是细胞的边界，将细胞与外界环境分开，控制物质进出细胞和进行细胞间的物质交流等，B正确；
C、细胞核内携带遗传信息的DNA，决定细胞结构和功能的主要原因，但同时，细胞核的自身代谢又离不开细胞质提供物质和能量，流动的细胞质保证了细胞内物质的运输，C正确；
D、细胞质基质是细胞器存在的液体环境，是进行新陈代谢的主要场所，D错误．
故选：D．
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