粘液对鱼本身来说，却有著很重要的保护作用。当鱼活著的时候，皮肤上有一种能分泌粘液的杯状细胞，不断地在分泌著粘液。这些布满鱼全身的粘液，能减少鱼在水中的摩擦，使鱼游得更方便，同时又能保护不受寄生物、霉菌、细菌和其他徵小的生物所侵蚀，又能使皮肤具有一种正常的渗透能力，防止体外物质随便进入身体里面，影响鱼体正常生活的能力。此外，粘液还有凝结和沈淀水中浮泥的力量，使生活环境的水清澈，对於栖息在经常混浊的水中的鱼，多少有延长生命的用处。对栖息在清水中的鱼类，当洪水或暴雨后引起混浊的时候，粘液也有著同样的作用，使鱼能顺利地进行呼吸，维持生命。
鱼死后，由於皮肤上有一层粘液存在，能延迟细菌对鱼表面的分解作用，使鱼不致太快变坏。但是，经过一定时间，细菌耗尽了所附著的粘液中的氮，使鱼开始起分解作用，鱼肉就变坏了。
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