这里的하자만并不能单独来看。这里是一个“…기는 …자만”的语法。表示在前一个分句对某一状态或行为表示了肯定，但主张却放在后面的一句。从你给的句子来看，这里应该翻译成：虽然小溪的水势很急，但是还是得从这里跨过去才行。
