农村合作医疗是社会医疗保险，支付宝的好医保是商业医疗保险。这两个保险性质不一样。按照商业医疗保险的合同，医疗费用社会医疗保险报销之后，商业医疗保险还需要按照保险合同给予报销。所以小病无所谓，大病要把两个保险都用起来。
两种都可以搭配着用，小病就用支付宝上的好医保，大病就用农村合作医疗在事后报销程序上更简单更实惠。
