有2个标记的质粒很常见的，主要为了选用抗生素的时候更加方便，根据实验的要求选用。和导入的基因无关，因为在导入前就存在的。你给的那个链接并没有全面回答这个问题。
比如TA克隆的质粒，一般带有2个抗生素抗药基因。另外，就像楼上说的，还有比如蓝白试验看有无序列插入克隆位点的，那就有至少3个标记基因了
目的基因导入质粒后，质粒导入受体细胞，是为了检测受体细胞中是否导入含目的基因的质粒
检验质粒是否进入细胞等更加方便。检验的手段也更加多（手段一多就有更方便、更节约的选项）。在这，限制性内切酶有可能把标记基因给“切没了”或者“切坏了”，多几个标记基因保险的多。
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