阿克苏市历史悠久。“阿克苏”系维吾尔语。“阿克”意白色，“苏”水也。
古代为西域姑墨国旧地。
清乾隆二十二年（1757）始定是名，原为道名，
清光绪年间置县时，道名随之沿为县名，称阿克苏县。
民国2年(1913)，温宿本府改为阿克苏县。
民国17年（1928），阿克苏道改为阿克苏行政区，阿克苏县受其管辖。
1958年5月29日经国务院批准，阿克苏县与温宿县合并为阿克苏县，
1962年10月又恢复温宿县，阿克苏县依旧存在。
1978年阿克苏县受阿克苏地区行政公署管辖。
1983年9月，撤县建市（县级）。
2012年2月6日，柯柯牙街道办事处正式挂牌成立。
2013年1月23日，自治区政府（新政函[2013]17号）批复同意将阿克苏市802.733平方千米区域划归阿拉尔市管辖。
2014年11月14日，自治区政府同意将现英巴扎街道管辖的英巴格社区、林园社区以及阿依库勒镇部分区域划入设立多浪街道，街道办事处驻现英巴格社区居委会办公楼。
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