人事代理的话,就是保管你的人事档案并由你交纳档案保管费,但不安排工作,也不会发放工资给你,更没有社保等。而劳动合同则是你与用人单位直接签订的能够直接证明你与用人单位之间存在劳动关系,用人单位应当依法参加社保和发放工资等。还有一种情况就是劳务派遣,而你提问中所讲的情况可能就是这种情况。
劳动合同直接受我国《劳动合同法》调整,当然,劳动合同更能维护劳动者的合法权益。