首先应该直接问问公司人事或人力资源,他们在这方面是最专业的。据我了解现在职工上社保和什么户口没有任何关系,如果你交的是省养老保险不论在省内什么地方工作,只需要把原单位的四联单转移过来,继续交就行,满15年退休后享受劳保。不是省保以后变更工作可以转移新开账户或合并(根据具体情况,到时候人事会告诉你怎么办理)!而且现在新户口本改了,基本上都是写的居民户口,也就是说不像以前那样特别区分农业和非农业的。以前农村户口的职工可以到退休时,将个人帐户的金额一次支取,但退休金是城市户口的多。至于你说的公司给你按非农业交的保险,有可能是你之前在大连或其它城市上大学,户口早就是非农的了,总之户口类型不是人事那边想怎么报都可以的,在处理这些繁琐问题上他们比咱们更专业。
放心吧,不会有问题,最近大连市出台了新政策,外来务工人员可以在大连参加城镇职工社会保险,交到60岁(女的50岁)即可以享受大连市本地市民的一切社会保险待遇。