等位基因是存在于同源染色体上相同位置的基因。而配子则是含有体细胞染色体数一半的细胞，一个配子中含有很多的基因，但对于二倍体生物来说，由于不含同源染色体，所以配子中是不会含有等位基因的。
配子是指生物进行有性生殖时由生殖系统所产生的成熟性细胞；等位基因位于同源染色体的同一位置上的基因。 控制这相对性状在形成配子的时候，等位基因被分离到不同的配子中 。
