不会相互影响，两个程序两个库，连接对应的数据库就可以了啊，IIS创建两个网站，绑定不同的域名，绝对互不影响的
商场管理系统有自己的数据库， 数据库文件可以附加到sql2000上。金蝶也有自己的数据库， 也可以附加到sql2000上， 他们两个数据库的名字是不一样的， 你到时候就可以不同的系统连接不同的数据库。
正常安装都不会影响的。都是可以共用的。
