一般还是你公司负责代扣代缴的。
交的时候
借：应交税费-应交营业税
贷：银行存款
同时处理代缴
借：银行存款
贷：应交税费-应交营业税
一般情况下所有的税收应该由你公司来缴纳(或代缴),分包的部分可以直接做支出.
借：营业税金及附加 （100万-60万）×税率
应付账款——分包方 60万×税率
贷：应交税金——营业税等 100万×税率
借：应交税金——营业税等 100万×税率
贷：应收账款——总包方 100万×税率
或者直接跳：
借：营业税金及附加 （100万-60万）×税率
应付账款——分包方 60万×税率
贷：应收账款——总包方 100万×税率
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