原因：气候、地理上的差异
干栏式房屋的特点是抬高房屋地板，以适应南方地区特殊的生存环境（潮湿，多虫），同时亦可利用下部空间。这对于后来楼阁的发明、并最终导致阁楼和二层楼房的形成有直接的启示。河姆渡干栏式建筑是中国最早的木构建筑，其梁架用榫卯衔接、地板用企口板密接，工艺技术相当成熟。
穴居主要分布在北方的黄土高原上，这里的土壤呈垂直节理结构，壁直立而不易塌陷，气候相对干燥，适合挖洞居住。穴居有半穴居和深穴两种。
类似差异：
食物差异，河姆渡人吃水稻，半坡人吃番薯等，即南稻北粟
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