羊肚菌覆土结束后即可浇水。菌丝要求在湿润的环境中生长，土壤相对含水量控制在50%—70%。
羊肚菌播种的时间一般在每年的10月至12月，菌丝在3摄氏度到25摄氏度内均能生长，最适宜温度为15至18摄氏度，低于3摄氏度或者高于25摄氏度菌丝生长停止或者死亡。菌种的播种量为每亩200千克，播种时要均匀准确地把菌种撒在培养料上，播完菌种后就可以覆土了，覆土厚度为3—5厘米，覆土结束后即可浇水。如果对土质要求严格的，可以适当的使用采法特菌肥，增加土壤中的活性有益菌，促进菌丝更好的生长。
羊肚菌菌丝的生长要避光保湿，而子实体的生长要弱光保湿，光线过强或者湿度不够都不利于菌丝和子实体的生长，所以必须搭建人工遮阳棚，遮阳棚分为平棚和拱棚。
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