我也出现过类似情况。当时我采取的措施是把Netbeans当前使用的服务器，比如我用的是glassfish，里面会有之前编译调试以及运行时的一些部署上去的东西，你打开server窗口，看里面存在的和之前那个项目相关的东西，全盘删除，应该就可以了，我就是这样解决的，你试试看行不行，不知道跟你的情况相同不。
在IDE里删除后 到你保存目录下再去删一次 2次彻底删除后 就没问题了。再建同名 的就不会出问题了!祝你成功！
