草酰乙酸由磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶催化可直接生成磷酸烯醇式丙酮酸。要生成乙酰乙酸就得先生成乙酰CoA,再走酮体合成路线。
乙酰乙酸通过加羧基可以生成草酰乙酸而磷酸烯醇式丙酮酸是光合作用的C4途径中才有的