A、叶绿体是进行光合作用的场所，光反应消耗水，暗反应在形成糖类的同时，会产生水，线粒体的内膜是有氧呼吸的第三阶段，产生水，核糖上进行脱水缩合反应，高尔基体与多糖的形成有关，在形成多糖的过程中，产生水，细胞核可以进行DNA的复制和转录，也产生水分，A正确；
B、光反应中ATP的形成的能量来源于光能，而不是来自于水的分解，B错误；
C、线粒体中能量的变化是稳定的化学能转变成ATP中活跃的化学能，不转化成光能，C错误；
D、原核生物没有核仁，也可以形成核糖体，D错误．
故选：A．
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