A、限制性内切酶和DNA连接酶都作用于磷酸二酯键(a处),其中限制性内切酶可以切断a处,DNA连接酶可以连接a处,A正确;B、DNA聚合酶能将单个脱氧核苷酸连接到DNA片段上,形成磷酸二酯键(a处),B正确;C、解旋酶作用于氢键(b处),C正确;D、DNA连接酶作用于磷酸二酯键(a处),而不是普通磷酸键(c处),D错误.故选:D.