不发生冲突，《吉林省工伤保险条例》调整范围为签订劳动合同的用人单位的职工，农民工不是签订劳动合同的职工，不具备劳动关系，是不适用于《吉林省工伤保险条例》的，因此个别省市出台了《农民工的工伤保险试行办法》，用来解决农民工的工伤问题，是工伤保险条例的补充。
