茎基腐病是土传病害,前茬作物把病菌留下土中,灌溉水或农事操作的传带都会感染下茬作物,土壤忽干忽湿或幼苗徒长,高温高湿都易发病。防治要在辣椒移栽定植前应清洁温室地面,进行高温闷棚。定植时,选用无病壮苗。增施磷、钾肥。发现病株用70%恶霉灵可湿性粉剂或30%苯醚甲环锉·丙环唑乳油灌根或喷雾茎基部。