为什么用sai画画时，打开线稿，用魔棒可以正常选区，可是下面新建的图层，用魔棒一选整张图都被选了

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没用过sai，只会Photoshop应该差不多。
因为你下面新建的图层应该是空白没有任何画（线稿）的。那你魔棒选取的话，也是没有东西可以选的。
如果你要选的话，可以现在线稿上用魔棒选好区域，不要把魔棒点掉，保持选区，然后再点你下面需要的图层。这样你魔棒所选好的区域就是在下面图层上了。然后该干嘛干嘛！
不知道说清楚没有，没听懂再追问吧！