影响和制约大学科学发展的突出矛盾和问题是什么？应当采取什么措施来解决？

哥们，你问的这个问题很有专业水平！
当前中国的高等教育可以说是得到了一个飞跃式发展，从100年前只有几所大学（清华北大）到现在全国普通本科高校有700多所，特别是扩招以来，中国的高等教育入学率大大提高，具体数据你可以自己查，我仅仅说一下大面上的。
但中国高等教育的水平与世界水平还有很大差距，连清华北大这样的中国顶级学府都排不进前200名！
制约中国高等教育发展的因素是什么呢，鄙人近从自己的观察来分析，因为坦白的说我不是专业人士，只是对高校发展比较关注而已。
首先，中国大学的学术不独立，大学领导官僚化，大学发展受计划体制约束现象严重。很多教授才开始做学术，有了成绩就提拔为官员，报纸上甚至出现40多个教授争聘一个副市长的职位。“官本位”的思想在我国千年的历史中一直占据主流，并将持续下去，“学而优则仕”祖先的谆谆教诲代代相传，中国的公务员是世界上最好的职业。所以，只要有了点成就，人们就拼命地巴结个官当当，然后把学术丢到一边。这与美国等西方国家的价值观完全不同，在西方学术与行政是分立的这样可以使那些优秀的专家专心的搞学术，不被成天的应酬分散精力。还有，中国的社会风气不尊重知识，绝大多数人会向当官的和有钱人低头哈腰，而大学教师则很少会受到应有的尊重。日本这个国家就对学术知识很尊重，人们纷纷以跟大学教授交往为荣，认为有大学教授这样的朋友很有面子，教授在社会上很有地位。
并且我国对教育投入占GDP比重与世界平均水平有很大差距，甚至不如很多非洲的落后国家，可见我国虽实施了科教兴国战略，但现在对教育的投入确实不足。
中国高等教育的快速发展也是导致现在大学教育质量大幅下降的原因之一。凡事有利必有弊。大学都在扩招，本身却不具备那么多教师或教育设施。扩招使本来水平不高上不了大学的学生也能进入大学，导致学生水平良莠不齐，素质下降。
中国在“以经济发展为中心”的指导下，经济获得了长足发展，同时伴随而来的就是人们道德文化的缺失，拜金主义盛行。在这种社会大背景下，象牙塔中的学生们也受到很大影响。
中国教育的整个定向就出现了“错误”。现在大学的好坏就业率是一个硬指标，大学培养的学生就是为了将来能找个好工作，养家糊口，上大学成了一种谋生手段，既然是谋生，那么如果通过其他渠道可以实现那学习就成了可有可无的东西，于是很多在校大学生摆摊卖地瓜挣钱，开小卖部挣钱，学生不再是兼职挣钱，而是在挣钱的时候兼职做做学生，听听课，考考试，本末倒置。

好了，写了不少了，借回答你的问题，整理出了我这段时间以来的“研究成果”，很浅显很幼稚，希望能帮助到你。（转载须注明出处，本人原创）