SSR用4%PAGE胶检测,加样时一定要注意最后分开加的引物家进去了,而且够量(0.5ul是很少的,要注意).我用的PCR程序是94度10分钟,94度35秒.55度35秒,72度45秒,35循环,最后再10分钟的72度.
你测到的1.8只是说明DNA比较纯,也许模板浓度不够啊,要达到5ng/ul以上才好用,模板浓度太低也扩不出来的.
你跑胶之后有没有引物二聚体的带,如果有,说明模板加的正常,如果没有,可能是加模板没加好.
水只要用灭菌的纯水就行了,没什么的,师兄都说PCR是很粗放,很简单的.加油!!!
你是不是引物加多了啊,PCR后run胶有100bp下有团带吗?还有一点是,“紫外分光光度计测DNA od260/280 1.8”用仪器有时候会有错觉的,当有酒精残余的时候测的也会很好,但是酒精影响PCR。用纯水没什么问题的,DNA浓度也不是个太大的问题,你在看看体系有没有忘加东西。
你是不是跑错胶了?不要用琼脂糖胶跑,要跑PAGE,然后染色或者显影,琼脂糖胶灵敏度低