出现箭头就按啊 拼刀模式是当初为了体现WII版而增加的新设定，后来移植的时候硬生生的套在了PSP上。在携带忍者刀的前提下被敌人发现就会进入拼刀模式。BOSS战也会在拼刀模式下进行。这种模式下分攻守（攻受？！）回合制，守的时候要用摇杆按照画面的提示做出指令。摇杆的指令方向稍微有偏差就会令刀身磨损，刀HP值就会下降，降为零的时候刀就会坏掉，角色也会马上被杀（前提是之前已经被发现过一次）。而指令严重错误（比如↑的时候按了←）同样会直接没命。
敌人HP下方有一条蓝色的槽，守阶段没防御成功一次该槽就会增加，直到满了后就能进入攻击阶段。攻击阶段要同样按照画面提示控制摇杆方向，同时按下□键进行攻击。值得一提的是，即使不按照只是攻击虽然同样会造成伤害，但远不如指令攻击，有时候放慢速度看准方向反而会使得输出更高！
操作
由于游戏中几乎所有的动作都有按键提示，所以看似复杂的操作其实并没有想象中的难。从WII平台上的操作回归着实让人异常欣喜，对于熟悉的操作方式玩起来也很舒服，看来受到WII特殊操作影响的玩家可以放心不少了，尤其是玩过前作---“忍大全”的玩家更能很快的上手了。虽然不能自由设置键位，但系统却提供了A、B、C、D西种不同的操作方式，这里就只介绍默认的A方式，以方便玩家了解并熟悉游戏的操作。
十字键上：丢弃忍具
十字键下：使用当前忍具
十字键左/右：切换自己的忍具(只能携带3种不同的忍具)
类比摇杆：前后为角色移动，左右为原地转动，配合L/R键有如下特技
类比摇杆+L键：快速移动
类比摇杆+R键：快速躲避、翻滚
三角键：按住后启动“心眼”模式，可以清晰看到同屏幕所有敌人的位置及视线，以及需要熄灭的灯和可以隐藏的位置
方块键：必杀等攻击性动作都是以此键完成
圆圈键：隐蔽按键，贴墙等常规动作都需要此键来完成
叉 键：跳跃，在水中上岸时和部分特定场景都需要用到
连续按两次R键：身体快速旋转180°
战斗系统
忍具：虽然大部分的时候都接近敌人后按方块键，然后利用类比摇杆选择四方向的任意一个来使用不同种类的必杀技，但作为一名出色的忍者，又怎能忽略忍具的使用呢?游戏中也为玩家提供了种类繁多的忍具供玩家使用，经常使用的忍具有如下几种，手里剑、忍猫、烟雾弹、可以存放水用来远程灭火的和潜水中用来呼吸的竹筒等，种类繁多的忍具可以在关卡中特定的位置找到，有些甚至是通关的必备用品。
方向键是不能操作的，是使用道具用的，拼刀有攻击和防御模式，防御是有方向提示，假如提示方向为上，就拉着摇杆向上不松开，直到攻击完毕，攻击是摁方块攻击，有单蓝的小方向建提示摇杆向哪拉，不会也没关系，只要防御成功了，两次不停按方块攻击就可以击杀了.
不能用那个方向键，用滑竿。它指示向上，你就向上。如果你有些措手不及，就在方向出现的时候用START，确定好了，再摁START
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