A、生物多样性包括遗传多样性、物种多样性和生态系统多样性三个层次,A正确;B、就地保护(建立自然保护区)是对生物多样性最有效的保护,B错误;C、生物与生物间、生物与无机环境间均会相互选择共同进化,C错误;D、保护生物多样性并不意味着禁止对自然资的开发利用,而是要合理开发利用,D错误.故选:A.