A、基因表达包括转录和翻译，线粒体和叶绿体都含有DNA和核糖体，都能发生遗传信息的转录和翻译，但核糖体只能发生翻译过程，故A错误；
B、细胞中膜蛋白的形成与内质网有关，需要内质网的加工和运输，故B错误；
C、叶绿体产生的ATP只能供给暗反应，不能供给其他生命活动，故C错误；
D、吡罗红和甲基绿对DNA和RNA的亲和力不同，其中甲基绿能使DNA变成绿色，吡罗红能使RNA变成红色，因此有关甲基绿和吡罗红混合染色剂时，能使细胞核区染成绿色，细胞质区域染成红色，故D正确．
故选D．
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