不一样的。What time is it by your watch?是标准的英文表达，意思是：根据你的手表，现在是什么时间？What time is your watch?是Chinglish（中式英文）的表述，不符合英语习惯（英语中没有这样的表达）。
差不多吧 就是问你手表的时间是多少
意思都是问“现在几点？”
