剧情内容几乎平行于动画版的电影院版。今年的电影将在7月于日本公映。
第一部系列剧场版:
1998年:神奇宝贝剧场版01-超梦的逆袭
1999年:神奇宝贝剧场版02-洛奇亚的爆诞
2000年:神奇宝贝剧场版03-结晶塔的帝王
2001年:神奇宝贝剧场版04-雪拉比的超越时空遭遇
2002年:神奇宝贝剧场版05-水都的守护神
超世代系列剧场版:
2003年:神奇宝贝剧场版06-七夜的许愿星
2004年:神奇宝贝剧场版07-裂空的访问者
2005年:神奇宝贝剧场版08-梦幻与波导的勇者
2006年:神奇宝贝剧场版09-沧海的王子
珍珠钻石系列剧场版:
2007年:神奇宝贝剧场版10-决战时空之塔
2008年:神奇宝贝剧场版11-冰空的花束
2009年:神奇宝贝剧场版12—超克的时空
2010年:神奇宝贝剧场版13—幻影的霸者佐罗亚库
1998年.超梦的逆袭(超梦打人 小智控制了这场灾难)
1999年.路基亚的爆诞(世界即将破灭 小智成了救世主)
2000年.结晶塔的帝王(同上!)
2001年.雪拉比穿越时空的遭遇(雪拉比与小智等人的故事)
2002年.水都的守护神(拉迪亚斯与拉迪欧斯的故事)
2003年.七夜的许愿星(基拉祈的故事)
2004年.裂空的访问者(裂空坐VS迪奥西斯)
2005年.梦幻和波导的勇者(路卡里欧的故事)
2006年.沧海的王子(小智和小遥 AND 马纳非的故事)
2007年.迪亚路加VS帕鲁奇亚VS噩梦神 又名决战时空之塔(根据名字就知道了)
2008年.冥王龙与冰空的花束-雪米(冥王龙和草刺猬之间的故事)
2009年.超克的时空(创世神的报复)
2010年.幻影的霸者Z (不详 未出待续)
1998年.超梦的逆袭
1999年.路基亚的爆诞
2000年.结晶塔的帝王
2001年.雪拉比穿越时空的遭遇
2002年.水都的守护神
2003年.七夜的许愿星
2004年.裂空的访问者
2005年.梦幻和波导的勇者
2006年.沧海的王子
2007年.迪亚路加VS帕鲁奇亚VS噩梦神
2008年.冥王龙与冰空的花束-雪米
2009年.超克的时空
2010年.幻影的霸者Z
超梦的反击、路基亚的爆庭、结晶塔里的帝王、雪拉比穿越时空的遭遇、水都的守护神、七星夜的许愿、裂空的访问者、梦幻与波导的勇者-鲁卡里欧沧海的王子、迪亚鲁加VS帕鲁奇亚VS达库菜伊、冥王龙也冰空的花束、超克的时空、幻影的霸者Z